Приведенные классификации микроорганизмов по их функциональным характеристикам создают комбинаторное пространство логических возможностей. Это пространство включает как области запрета для несовместимых комбинаций признаков, так и области максимального развития разнообразия. Важно, что бактерии наиболее полно используют пространство логических возможностей, далеко превосходя в этом отношении более дифференцированные организмы. С некоторым приближением можно сказать, что ячейки пространства логических возможностей для функциональных групп организмов соответствуют экологическим нишам. Классификации таких возможностей по разным параметрам и соответствующая терминология носят неформальный характер, но позволяют быстро ориентироваться в очень разнообразном материале.
124
Описание групп бактерий по их функционально значимым характеристикам было очень удобно для практических работников. Названия родов бактерий соответствовали их функции - например, Cytophaga - пожиратель клеточных стенок (целлюлозы). В основу, как уже говорилось, было положено представление о роде бактерий как морфо-физиологическом единстве. Далее они объединялись в более крупные группировки, например, азотфик-саторов, способных ассимилировать азот атмосферы. Природоведческая микробиология основывается прежде всего на таких функциональных характеристиках микроорганизмов.
Поэтому были созданы руководства практического характера, основанные на этом принципе и предназначенные для работы с не имеющими таксономического значения условными группировками. Издание книг, посвященных отдельным физиологическим группам микроорганизмов, например, анаэробам, хемоавтотро-фам, пропионовым бактериям, фотосинтезирующим бактериям, термофилам, представляет давнюю и очень удобную традицию в микробиологии. До появления филогенетической системы бактерий была сделана попытка систематизировать этот практический подход. На русский язык были переведены 8-е и 9-е издания Определителей Берджи, где бактерии были разбиты на группы, или секции, с задачей их определения по фенотипическим признакам. Перечисленные группы были созданы не по единой схеме, и, например, одну группу составили изогнутые бактерии, а другую - хемолитотрофы. Имеется 4-томник "Bergey's Manual of Determinative Bacteriology" с подробными описаниями видов и выходящее уже сейчас 10-е издание. Их дополняют 2- и 4-томные издания "The Prokaryotes", где вместе с характеристиками групп приводятся и методы выделения и культивирования. Кроме того, публикуются сводки, посвященные отдельным группам бактерий, составляющие важную часть литературы по общей микробиологии. Сейчас эта фенотипическая классификация заменяется филогенетической классификацией, основанной на гене 16S рДНК. Она привела к дроблению родов и все хуже коррелирует с функциональной.
Для естествоиспытателя необходимо знать функциональную групповую классификацию, так как именно она позволяет анализировать концептуальные связи в сложных природных системах.
125
